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石榴籽粒软硬度转录组分析取得新进展
发布时间: 2018-6-4 10:59:55 来源:中国干果果业网   浏览次数:176

本研究以成熟期 ‘‘三白’’石榴(硬籽,种子硬度﹥4.2kg/cm2)与‘‘突尼斯’’石榴(软籽,种子硬度﹤3.67kg/cm2为试材,通过测序共获得 12.67G 数据量,其中原始 reads 50679598 条,de novo 组装后共获得 36,642 Unigenes。,包括与 NTNRKEGGKOGGO 等数据库对Unigenes 进行生物信息学功能注释,共获得 13,803 Unigenes 的注释结果,同时获得SSR分子标记11907个。对各样品基因表达量和差异表达基因的分析,发现差异表达基因 840个,其中与木质素合成途径相关的显著差异基因18个。研究发现,石榴种皮形成与木质素相关,为深入开展种子形成相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的资源,为揭示石榴种子形成的分子机理打下了坚实的基础。相关研究进展发表在SCI期刊《PLOS One》(IF=2.806)上。

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